Bio-IT World提名2016年最佳实践获奖者

2016年4月6日

由Bio-IT World员工提供

2016年4月6日 |波士顿-Bio-IT World今天上午在Bio-IT World Conference and Expo上宣布了2016年最佳实践奖的获奖者。来自阿斯利康,DNAnexus,Amgen,Human Longevity和XOMA的参赛作品均受到表彰。

自2003年以来,“ Bio-IT世界最佳实践奖”一直在生物信息学,基础和临床研究以及用于生物学和药物发现的IT框架方面表现出色。今年,我们从五个类别中选出了获奖者 十七名决赛选手 named in mid-March.

“我们第一次参加最佳实践比赛已经十四年了,我继续受到我们领域工作的启发,” Bio-IT World编辑艾莉森·普罗菲特(Allison Proffitt)说。 “ Bio-IT世界社区日益开放,这里展示的合作伙伴关系和项目证明了我们致力于卓越合作的奉献精神。”

Bio-IT World在第二届Bio-IT World Conference&Expo上首次颁发了“最佳实践奖”,不仅希望提升信息技术在现代生物医学研究中的关键作用,而且着重强调可以在全球范围内广泛共享的平台和策略。工业界提高科学的质量,步伐和影响力。从那以后的几年中,每年的竞赛都进入了数百个项目,最杰出的作品也获得了80多个奖项。

今年,由十位受邀的专业法官组成的评审小组与《 Bio-IT World》编辑一起,审查了制药公司,学术中心,政府机构和技术提供商的详细意见。

颁奖典礼在波士顿海港世界贸易中心举行,获奖团队从Proffitt,资深法官,默克公司后期临床发展统计副总裁杰里·辛德勒和飞利浦总裁飞利浦·库尔那里领奖。会议组织者剑桥健康技术研究所。

2016年Bio-IT世界最佳实践奖获奖者:

临床IT和精密医学:Amgen

现实世界数据平台和分析

真实世界数据(RWD)平台改变了安进(Amgen)通过更快地交付创新型人类治疗产品为患者服务的追求。它提供了一个通用的高性能分析生态系统,其中包含大量现实世界中的患者索赔数据和电子病历,使流行病学家,分析师和科学家能够及时,经济高效地提供见解。我们使用敏捷方法来实施基于Hadoop的企业数据湖(EDL),以计算大型不同的数据集,并协调现实世界中的患者数据资产,患有疾病的患者队列和/或接受安进/竞争对手的疗法,从而在药物商业化生命周期中始终如一地解决问题。影响包括:

  • 加快对患者的影响–及时准确地识别患者群体,为临床研究设计/预测提供依据,从而更快地为患者提供新药
  • 对患者安全和价值的影响–进行有效且科学严谨的比较安全性/有效性分析,以及时告知安进公司药物的风险/益处

信息学:FDA和DNAnexus

FDA通过PrecisionFDA推动精密医学发展:一个协作的信息学社区,探索监管科学

食品药物管理局(FDA)在奥巴马总统的精准医学计划中扮演着不可或缺的角色,该计划预言了个人的医疗服务将部分根据其独特特征和基因组成进行定制的日子。为了加快实现这一愿景,FDA首席健康信息学官Taha Kass-Hout医师开始研究研发门户的概念,该门户将允许社区成员测试,试验,共享和验证现有的和新的生物信息学方法。处理使用下一代测序(NGS)技术收集的大量基因组数据。在进行了市场研究,与FDA设备与放射健康中心合作,将研发合同授予DNAnexus以建造precisionFDA并组建了一个项目团队之后,PrecisionFDA于2015年7月22日启动,并于2015年12月15日发布beta版。

知识管理:阿斯利康

CI360(竞争情报360)

CI360是由阿斯利康(AstraZeneca)内部的研究与开发信息(RDI)开发的竞争情报框架。它包括一个数据集成框架,药品和试验情况视图以及社区SharePoint Online网站。它使用大数据/链接数据技术的混合体来构建,以最大程度地提高可伸缩性和数据异构性,从而支持大量关键CI业务问题。

法官奖:人类长寿

HLI知识库和健康核心

Human Longevity Inc.(HLI)建立了一个基于云的多方面基因组和表型知识管理和应用生态系统,其中包括HLI知识库,HLI Health Nucleus客户和临床医生门户网站以及Health Nucleus集成化身应用程序。 HLI知识库当前包括10000多个综合健康记录以及以科学有意义的方式存储,查询和可视化基因组,代谢组学,微生物组和高质量表型数据的基础结构。作为知识库的关键来源,Health Nucleus套件的模式和应用程序提供了最广泛的表型和医学数据集,而Integrated Avatar应用程序将客户置于其集成基因组和表型结果的中心,从而带来了新颖而引人入胜的健康探索市场的新方法。这些应用程序一起代表了最先进的技术连续性,支持最广泛,最广泛的基因组学和表型知识管理解决方案的全面组装和实用性。

编辑选择奖:XOMA

XAbTracker和SeqAgent:用于抗体噬菌体展示的集成LIMS和序列分析工具

我们介绍了SeqAgent和XAbTacker,这是一个集成的DNA序列分析软件包,专门设计用于与从抗体噬菌体展示实验获得的抗体V区(Fv)一起使用,以及一个数据管理系统,该系统将跟踪从发现到检测,序列测定和最终鉴定的克隆进行克隆选择。 SeqAgent是一种半自动化的管道,可提取DNA输入文件,转换为蛋白质,识别结构特征并产生高度注释的序列,并准备进行最终分析。 XAbTracker为抗体发现提供了灵活的工作流程和数据管理,并与SeqAgent集成。这些平台是内部开发的,利用了Web应用程序和开源技术的最新最佳实践,从而导致了极低成本,强大而灵活的基于Web的研究管理系统。这些系统的开发大大缩短了数据分析和管理所需的时间,并增加了我们的药物发现工作量。