生物IT世界宣布就职创新实践奖获奖者

2019年4月18日

2019年4月18日| 波士顿— Bio-IT世界 宣布了2019年创新实践奖的获奖者。获奖者在Bio-IT World Conference&Expo上现场宣布。来自Abbvie,Novo Nordisk和Sentieon的参赛作品受到了表彰。

自2003年以来,Bio-IT World举办了一次精英奖颁奖活动,重点介绍了技术创新和战略举措如何成为生命科学变革(从基础生物医学研究到药物开发等)的强大力量的杰出例子。今年,我们表彰了创新实践奖,以表彰推动行业发展的伙伴关系和项目。

“这些奖项是对生命科学领域的奉献精神和创新精神的纪念,而获奖者将彰显我们行业正在开展的鼓舞人心的工作,” 生物IT世界编辑总监艾莉森·普罗菲特(Allison Proffitt)说。 “ Bio-IT世界社区越来越开放,今年的奖项计划中展示的合作伙伴关系和项目证明了我们对卓越合作的奉献精神。”

今年,由专家法官组成的小组参加了 生物IT世界 编辑审查制药公司,学术中心,政府机构和技术提供商的详细意见。

颁奖典礼在波士顿海港世界贸易中心举行,获胜的团队从Proffitt和会议组织者Cambridge Healthtech 研究所总裁Philips Philips那里获得了奖项。

2019 Bio-IT世界创新实践奖

获奖作品:

阿比维 由提名 鉴别

3Decision –下一代结构知识管理解决方案

尽管被广泛使用,但基于结构的合理药物设计(SBDD)技术远未充分发挥其潜力。主要障碍在于数据持久性不一致以及结构数据分析的复杂性。此外,结构数据通常仅由领域专家进行分析,并且他们的知识和经验没有得到很好的共享,也无法与其他社区共享。 阿比维通过共同开发称为3decision的基于Web的结构知识管理解决方案来解决这些陷阱。它使Abbvie可以将来自内部和公共3D结构和序列的大量数据转换为适用于药物发现项目的知识。 SBDD项目内的协作方面是重点,用户界面允许所有类型的用户轻松生成,测试并相互联系他们的想法。 3decision的发展使Abbvie大大提高了SBDD工作和蛋白质结构生产的投资回报率。

诺和诺德 nominated by 语言学

集成NLP以从现实世界数据生成可行的见解

诺和诺德(Novo Nordisk)希望从收集的有关其产品使用的真实数据(RWD)中获取更多价值,以便商业团队可以更好地了解患者和医疗保健专业人员在说什么,并采取适当的行动。 诺和诺德使用Linguamatics I2E分析了三个主要的RWD来源并提取结构良好的数据。然后,通过基于Tableau的自助式仪表板将结果信息呈现给业务用户,以进行探索和洞察。此外,Novo Nordisk将I2E和Tableau迁移到其基于AWS云的全球大数据和分析平台。现在,这为业务用户和产品团队提供了对Novo Nordisk产品周围现实世界数据的增强访问权限,以便更好地得出可行的见解。借助新系统,Novo Nordisk减少了FTE的人工工作,减少了供应商支出,自动化了产生见解的过程,并显着扩大了全球团队对这些见解的访问。

圣天

用于NGS数据处理的Sentieon DNAseq和TNseq软件工具-BWA / GATK的替代品

为了帮助基因组学行业而又不添加“另一个变种调用者”,Sentieon认为BWA / GATK是高质量的工具,因为它们的数学模型较为严格且具有很高的准确性。 圣天在此基础上使用重新设计的计算算法进行了改进,从而提高了效率,更好的可用性和100%的一致性。 圣天的软件包实现了与基于BWA-MEM,GATK,MuTect,MuTect2的管道相同的数学运算,同时减少了3-10倍的核心时间,降低了内存需求,并通过消除下采样和线程依赖性实现了100%的一致性。 圣天软件会自动扩展以有效使用所有可用的CPU内核。此外,改进的计算算法使Sentieon软件可以联合调用数万个基因组的大型队列,而无需中间步骤。作为这些改进的结果,Sentieon工具已用于赢得PrecisionFDA一致性挑战和真理挑战奖项,目前已被世界各地的客户使用。

荣誉提名:

Regeneron Pharmaceuticals和RGC UK Biobank联盟 nominated by 脱氧核糖核酸

RGC英国生物库联盟数据传递和同类浏览器

英国生物银行(UKB)已收集并开发了超过500,000个人的生物样本和数据资源。该资源对制药公司具有战略重要性,因为它有助于了解不同因素如何影响疾病。与制药公司财团合作,Regeneron遗传学中心已使用DNAnexus平台托管数据集并运行Regeneron的软件管道,对所有500,000个样品进行了外显子组测序和分析。为了增加对RGC UKB联盟的价值,Regeneron和DNAnexus合作建立了UKB基因组和表型数据的组合数据库,以通过创新的“基因/表型队列浏览器”用户界面进行探索。队列浏览器旨在使数据访问民主化,使不同的团队能够浏览100,000个样本中的3,000个表型字段和15,000,000个基因组变体,并建立队列。