10倍基因组学的百万细胞平台,高清空间转录组学等

2021年1月14日

2021年1月14日 | 10x 基因组学的首席执行官兼联合创始人Serge Saxonov在本周早些时候于旧金山举行的第39届J.P. Morgan医疗保健大会上描绘了单细胞技术的未来。

“对于我们来说,明确明确的是,将来需要对绝大多数生物组织样本进行大规模且高分辨率的分析,”萨克森诺夫说。他继续说,10x拥有实现这一未来的产品套件,包括新版本的Chromium平台,高分辨率版本的Visium平台,即将到来的In Situ平台,更广泛的10x Cloud推出以及新的工具。解决样品制备和成本问题。

 

铬:一百万个细胞实验

铬单细胞测序技术是基因组学的10倍’最古老的产品,Saxonov引用了2,000多个实验室的安装基础。“单细胞方法将成为全球数以万计实验室中许多类型的生物学实验的标准,”他说。 Saxonov说,10x正在对该平台进行大量投资。他宣布了新的试剂盒,以提高铬用户的负担能力和易用性。低通量(LT)单细胞基因表达解决方案,将降低初始采用和试行新项目的成本;和固定的RNA分析试剂盒。

Chromium X是该平台的最新版本,预计将于2021年下半年发布,Saxonov的报价为“around $100,000”。他说,Chromium X将使一百万个细胞实验成为例行程序。“我们的许多客户都对越来越大的实验产生了浓厚的兴趣,” he said. “我们同意。我们坚信,更大的试验规模将加速新发现并推动市场进一步扩展。”

在发布时,Chromium X将针对“最有前瞻性的客户,”萨克索诺夫说,列出了更大的单细胞普查项目,药物开发的组合式屏幕, 基于CRISPR的大规模基因敲除活动和免疫谱分析可能是早期应用。人口研究将是“a bit longer term,” he added.  

 

Visium:高分辨率空间转录组学

虽然Saxonov将Chromium平台描述为10倍’Visium Spatial 基因组学是最注重发现的工具,在更多的转换研究中大放异彩。“铬可以告诉你 什么 在样品中的单个细胞中发生—生物学的基本单位” he said. “使用我们的第二个平台Visium,您可以知道 哪里 事情正在发生。”

萨克森诺夫宣布推出Visium HD,这是一种单细胞分辨率的空间转录组学产品,预计将于2022年上半年推出,其可见度比当前的Visium解决方案高400倍。

“Visium HD基于基础微阵列技术的重大基础进步,” Saxonov said. “We believe that this—连同所有其他投资’re making—将把Visium建立为科学发现和转化研究的最佳平台。”

他还宣布了Visium平台的更新,以简化易用性。 FFPE的Visium解决了福尔马林固定石蜡包埋过程中RNA降解的挑战。 FFPE附件套件的基因表达将于2021年第二季度提供。VisiumCytAssist(预计2022年上半年)是一种台式设备,使用户可以在开始使用之前对安装在标准显微镜载玻片上的组织切片进行染色和预筛查Visium分析进行基因或蛋白质表达分析。

 

信息学与什么’s Next

最后,Saxonov分享了10x Cloud的广泛部署,这是一种软件即服务的信息学平台,可提供 去年限量发行.

“单细胞实验产生大量数据。要利用这些实验,需要精通处理该数据,对其进行存储,对其进行分析和可视化,” Saxonov said. “许多复杂的实验室都有满足其自身生物信息学需求的资源和能力,但是随着我们向生物学家和转化研究人员转移到世界各地越来越多的实验室,信息学方面的挑战已成为采用单细胞的越来越大的障碍。”

10x Cloud让客户可以免费存储数据并对其进行分析,而Saxonov强调10x Cloud是该公司的一项长期投资,并将在未来几年内看到新功能。

最后,Saxonov谈到了即将到来的Insitu Analysis平台,该平台源于内部开发以及10倍的开发’s 2020 收购Readcoor和Cartana.

“通过这些收购,我们获得了出色的技术,出色的团队和强大的知识产权产品组合,包括涉及多种技术方法的100多项授权专利,” he said. “我们打算对该平台进行大量投资,并为我们的客户构建许多出色的产品。”