在至少五个疾病变体中,大流行对寿命的影响,过去冠状病毒感染对免疫的作用:COVID-19更新

2021年1月22日

2021年1月22日 |在纽约验证的一个建模平台可以预测COVID-19在小城镇中的传播,美国人已经失去了超过一年的预期寿命,先前感染的抗体发挥了作用,并且废水进行了测序以追踪SARS-CoV-2变体。加上:新的建模工具可优先分配疫苗,并在药物重新定位上付出更多努力。

 

研究更新

佐治亚州立大学 生物学研究人员发现,用引起COVID-19的病毒感染小鼠的鼻道会导致迅速,逐步升级 攻击大脑 即使在肺部成功清除病毒后,也会引发严重疾病。受感染小鼠中严重疾病的发作与大脑中病毒峰值水平有关。他们的发现发表在《病毒》上。 DOI:10.3390 / v13010132

纽约大学的一个团队使用了 代理人基于建模的平台 以单个分辨率模拟COVID-19在小城镇中的传播。该平台已根据来自纽约州新罗谢尔的真实数据进行了验证—在美国注册的首批暴发之一。该模型结合了在统计上现实的人群中传播的详细要素,并说明了症状类似于COVID-19的其他疾病的负担。该模型表明,高危人群的优先接种疫苗对COVID-19死亡人数的影响很小。镇上四分之一的居民接受了疫苗接种后,可以看到更大的进步。重要的是,在第一波期间实施限制性措施的好处大大超过了这些选择性疫苗接种方案中的任何一种。作者指出,该模型有局限性。在《高级理论与仿真》中发表了该模型。 DOI:10.1002 / adts.202000277

由...领导的研究结果 北亚利桑那大学和转化基因组学研究所(TGen) 并在《细胞报告医学》(Cell 报告书Medicine)上发表的文章表明,感染COVID-19的人的免疫系统可能依赖于早期冠状病毒感染过程中产生的抗体来帮助抵抗这种疾病。该团队使用高度多重的肽测定法(PepSeq)研究了交叉反应性,以产生抗原决定簇分辨的视图,显示在COVID-19恢复期和阴性供体中所有人类CoV的IgG反应性。 PepSeq可解决SARS-CoV-2 Spike和Nucleocapsid蛋白中的抗原决定簇,这些蛋白通常在恢复期供体中靶向,包括在一些未感染对照中也能识别的几个位点。他们发现,SARS-CoV-2引发了在两个Spike S2亚基表位交叉识别大流行和地方性CoV抗原的抗体,并且这些交叉反应性抗体优先结合地方性同源物。这些发现突出显示了SARS-CoV-2应答似乎受先前CoV暴露影响的部位,并有可能引起广泛的中和应答。 DOI:10.1016 / j.xcrm.2020.100189

废水的超转录组测序 可用于描述跨感染社区的病毒遗传多样性。研究人员直接对旧金山湾区市政公用事业区收集的污水中的RNA进行测序,以生成完整和几乎完整的SARS-CoV-2基因组。在污水中检测到的主要共有SARS-CoV-2基因型与该地区的临床基因组相同。这组作者说,这项研究证明,通过废水测序进行的流行病学监测可以帮助在流行病背景下追踪确切的病毒株。他们的结果发表在mBio上。 DOI:10.1128 / mBio.02703-20

一个德国研究小组使用了来自轻度和重度COVID-19患者的全血转录组和粒细胞制品的RNA序列,并结合了常规和数据驱动的共表达分析来分析数据。他们的发现 将COVID-19疾病分层由SARS-CoV-2冠状病毒引起的,至少分为五种不同的变体,其免疫系统对感染的反应方式不同。此外,分层的转录组预测了针对宿主体内全身免疫反应失调的患者亚组特异性药物候选物。他们的发现发表在《基因组医学》上。 DOI:10.1186 / s13073-020-00823-5

来自加拿大高级研究所的一组研究人员呼吁对 2019冠状病毒病大流行’影响人类微生物组的潜力 在PNAS中被感染和未感染的个体中。目前尚无直接证据表明SARS-CoV-2病原体与人类微生物组之间存在相互作用,但作者建议宿主微生物种群可能会影响对初始感染,随后的发病机制和临床结果的敏感性,因此有必要对SARS-CoV-2感染期间微生物群的变化。另外,用于预防COVID-19传播的控制措施,尽管有必要,但可能会影响人类微生物组。 DOI:10.1073 / pnas.2010217118

休斯顿卫理公会研究所的一个团队 EMR数据确定男性是否更可能患SARS-CoV-2 相比女性,如果在住院的COVID-19患者中,男性性别与COVID-19严重程度和院内预后差独立相关。尽管来自中国和欧洲的证据表明,男性感染COVID-19的死亡率高于女性,但缺乏美国人群的证据。该小组研究了来自96,473位进行过COVID-19测试的个人的数据。约有15,000例测试阳性,约4,800例住院,其中452人死亡。在所有接受测试的个体中,SARS-CoV-2总体阳性率为15.5%,男性高于女性。在对年龄,种族,种族,婚姻状况,保险类型,中位数收入,BMI,吸烟和17种合并症进行调整后,这种性别差异仍然存在。较高比例的男性(相对于女性)在住院期间经历了肺部(ARDS,低氧性呼吸衰竭)和肺外(急性肾损伤)并发症。调整后,与女性相比,男性的住院时间(LOS),机械通气需求和院内死亡率显着更高。研究结果发表在PLOS。 DOI:10.1371 / journal.pone.0245556

南加州大学和普林斯顿大学的研究人员预测,由于2020年的大流行死亡, 美国人的预期寿命将缩短1.13年 根据他们在《美国国家科学院院刊》上发表的研究结果,发现这一年龄为77.48岁。这是至少40年以来最大的预期寿命单年下降,也是自2003年以来估计的最低预期寿命。预期寿命的下降影响所有种族,但甚至可能在少数族裔中更为明显。研究人员预测,对于黑人来说,他们的预期寿命将缩短2.10年,至72.78岁;对于拉丁美洲人,其预期寿命将缩短3.05年,至78.77岁。白人的预期寿命为0.68年,预期寿命为77.84年。 DOI:10.1073 / pnas.2014746118

糖尿病药物的使用 二甲双胍在诊断COVID-19之前 根据阿拉巴马大学伯明翰分校的一项种族多样化研究,这种疾病与2型糖尿病COVID-19患者的死亡率降低三倍有关。该小组于2月底至6月底在阿拉巴马大学伯明翰大学医院对25326名接受COVID-19检测的受试者进行了回顾性电子健康记录数据分析。在黑人/非裔美国人以及肥胖,高血压和糖尿病患者中,收缩COVID-19的优势比过高,但诊断为COVID-19之前的二甲双胍治疗与死亡率显着降低独立相关糖尿病和COVID-19。这些发现增加了二甲双胍可能在这种高危人群中提供保护性方法的可能性。研究结果发表在《内分泌前沿》上。 DOI:10.3389 / fendo.2020.600439

 

行业动态

两家韩国公司—基于AI和NGS的药物开发公司Syntekabio,以及生物制剂,化学实体和药物的制造商Hanmi Science—已经进行战略合作以共同开发 使用药物重新定位技术的突破性COVID-19治疗。根据新协议,Syntekabio和Hanmi Science将利用Syntekabio调查现有候选药物对抗COVID-19以及其他疾病的潜在功效’专有的AI药物发现平台:DeepMatcher。药物重新定位和适应症扩展研究将使两家公司从事临床开发活动,同时管理法规事务。从研究中获得的数据将用于为临床实践开发数字治疗平台。此外,Syntekabio和Hanmi Science将共同推动Syntekabio的临床发展’专有的COVID-19治疗:扎鲁司特-亚磺吡嗪联合治疗。 新闻稿.

Jubilant Therapeutics与Wistar 研究所合作评估在这种情况下Jubilant Therapeutics提供的肽基精氨酸脱亚氨酶4(PAD4)抑制剂阻断中性粒细胞胞外陷阱(NET)形成的能力 与COVID-19相关的细胞因子风暴。 PAD4是一种酶,可催化包括组蛋白在内的蛋白质中精氨酸向瓜氨酸的转化,并在嗜中性粒细胞中高度表达。组蛋白瓜氨酸化与中性粒细胞胞外陷阱(NET)的形成有关,并且越来越多的证据表明,NETs可能与COVID-19的严重程度有关,因为它们的形成是促炎性细胞因子释放综合征(CRS)或细胞因子风暴的结果由机体对SARS-CoV-2病毒的免疫反应产生。细胞因子风暴与急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的发展有关,ARDS是感染COVID-19的患者的主要死亡原因。 新闻稿.

威斯康星大学医学院和公共卫生学院以及威斯康星大学卫生学院的研究人员开发了一种工具,该工具将一个人的年龄和社会经济地位纳入 优先分配疫苗 那些因工作而分担类似风险的人。该工具可帮助识别那些因COVID-19遭受严重并发症或死亡的风险更高的人。虽然UW-Madison工具在设计时就考虑到了合格接受者的第一阶段,但随着疫苗分发范围扩大到更多人群,可以使用它。随着合格人口的增加,初始供求之间的差距可能会扩大,从而使这种优先排序工具更加有用。 新闻稿.

A 新的英国国家研究项目 研究SARS-CoV-2中正在出现的突变的影响 £英国研究与创新局(UKRI)提供了250万美元的资金。 “ G2P-UK”国家病毒学协会(基因组到表象组)将研究病毒的突变如何影响关键结果,例如其可传播性,其引起的COVID-19的严重性以及疫苗和治疗的有效性。该财团将召集来自英国10个研究机构的领先病毒学家,与在病毒基因组测序领域发挥世界领先作用的COVID-19基因组学英国(COG-UK)财团以及英国公共卫生共同合作,共同推动英国具有研究新发现的病毒变体并迅速告知政府政策的能力。 新闻稿。